2024年6月12日，高性能計算中心在線上成功舉辦了第二次“超算心得智享會系列講座”。本次講座采用騰訊會議形式，特邀万泰娱乐精密光譜科學與技術國家重點實驗室研究員梅曄老師作為主講嘉賓。梅老師專註於多尺度分子模擬中的統計分析方法及其在結構生物學中的應用，並榮獲上海市青年科技啟明星、上海市拔尖人才和東方學者等殊榮💂♀️🧟。他已在科研領域發表學術文章百余篇♈️，並坦言“幾乎每一篇學術論文都離不開超算中心的支持”🥍。
梅老師是高性能計算集群的資深用戶👥，自華師大超算第一期建設就開始利用超算中心進行科研研究♿️，至今已逾十年。盡管擁有多年的豐富經驗，他仍謙虛地表示這些經驗可能略顯“傳統”，期待在講座中與聽眾深入交流👨🏼🎨，共同切磋。梅老師主要的專業領域是生物大分子的模擬，Amber24分子動力學模擬軟件，是他日常科研中的關鍵工具🤳🏼🤛🏿。本次經驗分享梅老師以在八期上安裝Amber24為例，從使用的角度分享超算平臺上軟件安裝的一次實踐。
首先🏂🏼，梅老師演繹了在超算平臺上的軟件安裝過程🤦♂️，介紹了超算平臺的硬件配置🅱️，包括CPU核心數量🔲📋、GPU類型😈🐽、高速網絡互聯等💺。接著🧜🏽♂️，梅老師講述了CUDA編程環境與GPU計算配置，並針對Amber軟件包串行和並行兩個版本展開講解。梅老師的講述細致，針對其中可能遇到的問題包括GCC版本過低、網絡配置問題等，他提出可以通過更新GCC和調整網絡設置解決🌹🏃🏻➡️。此外，梅老師還介紹了OpenMPI並行計算環境配置，用於實現節點間的通信和同步。本次講座不僅重現了在超算上進行Amber專業軟件安裝的完整過程，也講解了如何避免在GCC編譯器⛑、OpenMPI等通用環境問題上“踩坑”⛺️，幹貨滿滿。
在講座的最後⤵️，梅老師和學生的交流環節成為了亮點之一🗽。學生們展現出了濃厚的學習興趣和強烈的求知欲🚵🏽♂️，紛紛就技術細節、編譯過程中的實際操作問題向梅老師請教👩🦳👩🏿。問題涵蓋了系統時間不匹配、重裝系統後恢復工作進程、並行計算時間差異等多個方面🙆♀️，梅老師均一一耐心解答，現場討論氛圍熱烈💃🏽😧。
通過這次講座📫，同學們不僅了解到了超算平臺對科研的強大推力👐🏻，還深入體會到了超算在科研中的廣泛應用和重要作用↖️，紛紛表示要進一步了解和學習超算平臺📓🧑⚖️，講座在超算平臺網站的學習資源分享中順利落下帷幕🧑🏻⚕️。
供稿：高性能計算中心